99 seri numaralı Katma Değer Vergisi Genel Tebliği’nde indirimli orana tabi işlemlerden doğan KDV iade alacağının yılı içinde mahsuben iade edilemeyen kısmının, izleyen yıl içinde mükellefin isteğine bağlı olarak, nakden veya mahsuben iade edilebileceği belirtilmiştir. İade talebinin en erken izleyen yılın Ocak dönemine ait olup Şubat ayı içinde verilecek, en geç

Kasım dönemine ait olup Aralık ayı içinde verilecek KDV beyannamesi ile yapılması gerektiği ifade edilmiştir.

Katma Değer Vergisi Kanunu’nun 29. maddesinde yeralan düzenlemeye paralel olarak Bakanlar Kurulu tarafından vergi nispeti indirilen teslim ve hizmetlerle ilgili olup teslim ve hizmetin gerçekleştiği vergilendirme döneminde indirilemeyen ve tutarı Bakanlar Kurulunca tespit edilecek sınırı aşan vergin, bu mükelleflerin vergi ve sosyal sigorta prim borçları ile genel ve katma bütçeli idareler ile belediyelere olan borçlarına ya da döner sermayeli kuruluşlar ile sermayesinin % 51′i veya daha fazlası kamuya ait olan veya özelleştirme kapsamında bulunan işletmeler organize sanayi bölgelerinden temin ettikleri mal ve hizmet bedellerine ilişkin borçlarına mahsuben ödenebilmektedir.

Yılı içinde mahsuben iade edilemeyen vergi de izleyen yıl içinde talep edilmesi şartıyla nakden veya mükellefin yukarıda sayılan borçlarına mahsuben iade edilebilir.

99 seri numaralı Katma Değer Vergisi Genel Tebliği’nde indirimli orana tabi işlemlerde iade uygulamasının usul ve esaslarına yer verilmiştir. Tebliğ çerçevesinde, 2008 takvim yılında gerçekleşen indirimli orana tabi işlemler nedeniyle doğan KDV iadelerinin talep edilebilmesi için son başvuru tarihi, 2009/Kasım dönemi KDV beyannamesinin verilme süresinin son günü olan 24 Aralık 2009 tarihidir.

İade talebi 2009/Kasım dönemi KDV beyannamesi ile yapılacaktır. En geç bu tarihe kadar iade talebinde bulunmayan mükellefler bu haklarını kaybederler.

Diğer KDV iadelerinden farklı olarak indirimli orana tabi işlemler nedeniyle doğan iade talebinin belirtilen süre içerisinde yapılmaması halinde, sonradan düzeltme beyannamesi verilerek tercih hakkının iade yönünde değiştirilmesi malesef mümkün değildir.

Diğer taraftan 2008 takvim yılı içerisinde indirimli orana tabi iade talebinde bulunan, ancak cari yıl içerisinde talep edilen iade tutarının tamamını mahsup yolu ile kullanmayan mükellefler de bakiye alacak tutarlarını aynı tarih içerisinde yeniden yıllık iade uygulaması çerçevesinde beyan ve talep edebilirlerdi.

Bu şekilde bakiye alacaklarını yeniden beyan edip iade talep etmeyen mükellefler de bu haklarını kaybederler.

Maliye Bakanlığı bu konuda 27.1.2010 tarihinde bir sirküler yayınlayarak ( KDV – 53 / 2010 – 1 ) yeni uygulamanın amaçlarını ve uyulacak esasları açıkladı.

KDV iade talepleriyle ilgili olarak her ne kadar VEDOP sistemi üzerinden beyanname eki olarak verilme olanağı olsa da manuel olarak yapılan kontroller uzun zaman almakta ve vergi dairesi çalışanları açısından da ciddi bir iş yükü oluşturmaktaydı. Dolayısıyla geciken iade işlemleri de mükelleflerin sızlanmalarına sebep olmaktaydı.
Yeni zorunluluklar çerçevesinde ilk amaçlanan, zaman tasarrufu, kırtasiyeciliğin ortadan kaldırılması ve KDV iade talebi işlemlerinin idari uygulamalar açısından en azından alış satış ve Ihracat bilgileri yönüyle  standart bir kontrole tabi tutulabilir hale getirilmesi.

Kontroller,  KDV İadesi Risk Analizi Projesi kapsamında, elektronik ortamda yapılacak ve Gelir İdaresi Başkanlığı tarafından, özet bir rapor halinde vergi dairesinin kullanımına sunulacak.

Kimler Listeleri Elektronik Ortamda Verecek ?

KDV mükelleflerinin tamamı iade taleplerini bu uygulama kapsamında yapacaklar.

Söz konusu listelere, fatura düzenleme limitinin altında kalsa dahi her bir belge kaydedilecek, aynı mükelleften yapılan alımlar belge bazında bu listelere ayrı ayrı girilecek, iade talebine ilişkin olarak ibrazı gereken ve bu listelerin dışında kalan diğer belgelerin önceden olduğu gibi vergi dairesine intikal ettirilmesine devam edilecek.

Elektronik ortamda alınan indirilecek ve yüklenilen KDV listeleri ile satış faturaları listesinin ve iade için ibrazı istenilen durumlarda gümrük (çıkış) beyannamesi listesinin ayrıca kâğıt ortamında verilmesine bu uygulamayla birlikte son verilmiş oldu.

Ancak liste ve dökümler elektronik ortamda VEDOP sistemine girilse de, mükelleflerin iade taleplerini yine dilekçe ile yapacaklar ve talepleri,  iade için aranılan diğer tüm belgelerin vergi dairesine ibraz edildiği tarih itibarıyla geçerlilik kazanacak.